Using NMDS to study patterns of treespecies composition in Dong Nai Biosphere Reserve

Authors

  • Nguyen Thi Thuy Viện Nghiên cứu Lâm sinh, Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Tran Lam Dong Viện Nghiên cứu Lâm sinh, Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Hoang Thanh Son Viện Nghiên cứu Lâm sinh, Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Trinh Ngoc Bon Viện Nghiên cứu Lâm sinh, Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Ninh Viet Khuong Viện Nghiên cứu Lâm sinh, Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Phung Dinh Trung Viện Nghiên cứu Lâm sinh, Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Nguyen Thi Thu Huong Viện Nghiên cứu Lâm sinh, Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Tran Hoang Quy Viện Nghiên cứu Lâm sinh, Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Nguyen Van Tuan Viện Nghiên cứu Lâm sinh, Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Duong Quang Trung Viện Nghiên cứu Lâm sinh, Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Do Thi Thanh Ha Trường Đại học Southern Cross University Australia

Keywords:

Non - metric Dimensional Scaling (NMDS), species composition, forest ecology,, Dong Nai Biosphere Reserve

Abstract

A common problem that studies in forest community ecology often address
is toidentify the similarities/differences in the species compositions of
different areas or following different silvicutural treatments and forest
restoration techniques. To the present, most of the studies in community
ecology in Vietnam have used study plots to characterize the species
compositionand describe the similarities/differences among the plots with
species composition formular. However, this method faces many
challenges in identifying patterns for a large numbers of plots. This paper
presents the application of Non - Metric Dimensional Scaling (NMDS) for
identifying species - association patterns in community assembly among a
large number of study plots. The identified pattern is then described with
other environmental factors to reveal more information about the
communities. To demonstrate the use of NMDS, we use 253 1,000 m
2
study plots that were established during 2015 - 2017 across the Dong Nai
Biosphere Reserve

References

1. Bruelheide, H., Böhnke, M., Both, S., Fang, T., Assmann, T., Baruffol, M., Bauhus, J., Buscot, F., Chen, X. - Y., Ding, B. - Y., Durka, W., Erfmeier, A., Fischer, M., Geißler, C., Guo, D., Guo, L. - D., Härdtle, W., He, J. - S., Hector, A., Kröber, W., Kühn, P., Lang, A.C., Nadrowski, K., Pei, K., Scherer - Lorenzen, M., Shi, X., Scholten, T., Schuldt, A., Trogisch, S., Oheimb, von, G., Welk, E., Wirth, C., Wu, Y. - T., Yang, X., Zeng, X., Zhang, S., Zhou, H., Ma, K. & Schmid, B., 2011. Community assembly during secondary forest succession in a Chinese subtropical forest. Ecological Monographs, 81, 25-41.

2. Bulafu, C., Baranga, D., Mucunguzi, P., Telford, R.J. & Vandvik, V., 2013. Massive structural and compositional changes over two decades in forest fragments near Kampala, Uganda. Ecology and Evolution, 3, 3804-3823.

3. Culmsee, H., Leuschner, C., Moser, G. & Pitopang, R., 2010. Forest aboveground biomass along an elevational transect in Sulawesi, Indonesia, and the role ofFagaceae in tropical montane rain forests. Journal of Biogeography, 37, 960-974.

4. Holland, S., 2008. Non - metric multidimensional scaling (MDS). [accessed 23 May 2018].

5. Katovai, E., Sirikolo, M., Srinivasan, U., Edwards, W. & Laurance, W.F. 2016. Factors influencing tree diversity and compositional change across logged forests in the Solomon Islands. Forest Ecology and Management, 372, 53-63.

6. Kenkel, N.C. & Orlóci, L., 1986. Applying Metric and Nonmetric Multidimensional Scaling to Ecological Studies: Some New Results. Ecology, 67, 919-928.

7. Kruskal, J.B., 1964. Nonmetric multidimensional scaling: a numerical method. Psychometrika, 29, 115-129.

8. Lefcheck, J.S., 2012. NMDS tutorial in R. URL https://jonlefcheck.net/2012/10/24/nmds - tutorial - in - r/[accessed 23 May 2018].

9. Legendre, P. & Gallagher, E.D., 2001. Ecologically meaningful transformations for ordination of species data. Oecologia, 129, 271-280.

10. Nguyễn Đắc Triển, Bùi Thế Đồi, Phạm Minh Toại Ngô ThếLong, 2014. Nghiên cứu đặc điểm tái sinh lỗtrống rừng lá rộng thường xanh tại Vườn Quốc gia Xuân Sơn. Tạp chí Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, Kỳ1 - Tháng 10.

11. Oksanen, J., 2004. Multivariate Analysis in Ecology.

12. Oksanen, J., Blanchet, F.G., Friendly, M., Kindt, R., Legendre, P., McGlinn, D., Minchin, P.R., OHara, B.R., Simpson, G.L., Solymos, P., Henry, M., Stevens, H., Szoecs, E. & Wagner, H., 2018. vegan: Community Ecology Package. R package version 2.5 - 2.

13. R Core Team., 2018. R: A language and environment for statistical computing. Vienna, Austria. [accessed 24 May 2018].

14. Trần Lâm Đồng, 2018. Nghiên cứu đánh giá diễn thếphục hồi hệsinh thái rừng và đềxuất giải pháp bảo tồn tại Khu dựtrữSinh quyển Đồng Nai. Báo cáo tổng kết đềtài nghiên cứu khoa học cấp Quốc gia. B.) Modern Applied Statistics with S, Fourth Edition. Springer, New York.

Published

04-04-2024

How to Cite

[1]
Thuy, N.T., Dong, T.L., Son, H.T., Bon, T.N., Khuong, N.V., Trung, P.D., Huong, N.T.T., Quy, T.H., Tuan, N.V., Trung, D.Q. and Ha, D.T.T. 2024. Using NMDS to study patterns of treespecies composition in Dong Nai Biosphere Reserve. VIETNAM JOURNAL OF FOREST SCIENCE. 2 (Apr. 2024).

Issue

Section

Articles

Most read articles by the same author(s)

1 2 3 4 5 6 > >>