Evaluation of genetic diversity and relationship of introduced Sonneratia apetela Buch - Ham provenances in Vietnam using ISSR markers

Authors

  • Nguyen Thi Viet Ha Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Nguyen Thi Huyen Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Le Thi Thuy Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Tran Thi Thu Ha Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Mai Thi Phuong Thuy Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Mai Thi Phuong Thuy Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Ha Thi Huyen Ngoc Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Le Son Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Le Van Thanh Viện Nghiên cứu Sinh thái và Môi trường rừng - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Ta Van Han Viện Nghiên cứu Sinh thái và Môi trường rừng - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam

Keywords:

DNA markers, genetic diversity,, ISSR,, Sonneratia apetala Buch - Ham

Abstract

Sonneratia apetela Buch - Ham has been planted in some mangrove
ecosystems in Nam Dinh and Thai Binh provinces. Despite of being widely
used in afforestation in these areas, there is no baseline of genetic information
of this species regarding to genetic diversity. The use of molecular markers to
assess genetic diversity among S. apetela provenances will, therefore, provide
the essential information for breeding and deployment program for this
species. In this study, 8 ISSR markers were used to evaluate the genetic
diversity and relationship between 6 provenances of S. apetala, which were
imported and planted in Nam Dinh and Thai Binh. A total of 87 DNA
fragments were detected, in which 63 were polymorphic (72.61%). The result
showed the high level of genetic diversity of studied samples (h = 0.257). The
genetic similarity coefficient among provenances ranged from 0.892 to 0.966.
The phylogeny of S. apetela were divided into 2 branches, the first one has
only provenance from Myanmar in 2003 and the other consisted of 5 remained
provenances (Hainan, Guangdong, Myanmar in 1995, Tanintharyi - Myanmar,
Ayeyarwady - Myanmar). Some recommendations for breeding and deployment
programs were also addressed.

References

1. Ahmed A. , Rashid M., Hasan S., Islam Md Nurul, and Rashid P., 2017. Rapd and ssr analysis of afforested Sonneratia apetala Buch-Ham. Population from the coastal areas of Bangladesh. Bangladesh Journal of Botany, 46 (3): 1001 - 1007

2. Botstein, D., White, R.L., Skolnick, M., Davis, R., 1980. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetic, 32(3): 31 4 - 331.

3. Doyle J.J. and Doyle J.L., 1987. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochem. Bull. 19: 11 - 15.

4. Hà Thị Mừng, Lê Văn Thành, Đinh Thanh Giảng, 2016. Bần không cánh (Sonneratia apetala Buch - Ham) -Loài cây trồng rừng ngập mặn góp phần ứng phó với biến đổi khí hậu vùng ven biển Bắc Bộ. Tạp chí Khoa học Nông nghiệp.

5. Mishra P.K., Fox R.T.V., Culhamm A., 2003. Inter - simple sequence repeat and aggressiveness analysis revealed high genetic diversity, recombination and long range dispersal in Fusarium culmorum. School of Plant Sciences, The University of Reading. Whiteknights, Reading PG6 6AS, UK. Association of Applied Biologists.

6. Narzary D., Rana T.S., Ranade S.A., 2010. Genetic diversity in inter-simple sequence repeat profiles across natural populations of Indian pomegranate (Punica granatum L.). Plant Biol (Stuttg). 12(5): 806 - 13

7. Peakall R., DNA P.E., Smouse, 2006. Genalex 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching DNA research. Molecular Ecology Notes. 6(1): 288 - 295.

8. Phạm Hoàng Hộ, 2000. Cây cỏ Việt Nam. Nhà xuất bản Trẻ, TP Hồ Chí Minh.

9. Rao V R and Hodgkin T, 2002. Genetic diversity and conservation and utilization of plants genetic resources. Plant Cell, Tissue and organ Culture 68: 1 - 19.

10. Lê Văn Thành, Đỗ Thị Kim Nhung, Phạm Ngọc Thành, Trần Văn Cao, Nguyễn Khắc Hiếu, 2018. Đặc điểm cây trội Bần không cánh (Sonneratia apetala Buch-Ham) ở vùng ven biển Bắc Bộ và Bắc Trung Bộ, Việt Nam. Tạp chí Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, 17: 132 - 138

11. White T.L., Adams W.T., Neale D.B., 2007. Forest genetics. CABI Publishing, Cambridge, MA, USA.

12. Yelin Huang, Fengxiao Tan, Guohua Su, Shulin Deng, Hanghang He, Suhua Shi, 2008. Population genetic structure of three tree species in the mangrove genus Ceriops (Rhizophoraceae) from the Indo West Pacific. Genetica. 113: 47 - 56

Published

04-04-2024

How to Cite

[1]
Ha, N.T.V., Huyen, N.T., Thuy, L.T., Ha, T.T.T., Thuy, M.T.P., Thuy, M.T.P., Ngoc, H.T.H., Son, L., Thanh, L.V. and Han, T.V. 2024. Evaluation of genetic diversity and relationship of introduced Sonneratia apetela Buch - Ham provenances in Vietnam using ISSR markers. VIETNAM JOURNAL OF FOREST SCIENCE. 5 (Apr. 2024).

Issue

Section

Articles

Most read articles by the same author(s)

1 2 3 4 > >>