Đánh giá đa dạng di truyền các nguồn giống cây Đàn hương trắng (Santalum album L.) tại Việt Nam bằng chỉ thị phân tử ISSR
DOI:
https://doi.org/10.70169/VJFS.1022Từ khóa:
Chỉ thị phân tử, đa dạng di truyền, Đàn hương trắng, ISSRTóm tắt
Trong nghiên cứu này, mức độ đa dạng di truyền và cấu trúc quần thể của 120 mẫu Đàn hương trắng (Santalum album L.) từ 8 nguồn giống/xuất xứ thu ở các rừng trồng tại Hòa Bình, Quảng Ninh và Bắc Giang được đánh giá thông qua sử dụng chỉ thị phân tử ISSR. Qua sàng lọc từ 20 mồi ban đầu, đã xác định được 5 chỉ thị ISSR có mức độ đa hình cao để sử dụng trong nghiên cứu này. Kết quả thu được 62 phân đoạn DNA trong đó có 41,73% phân đoạn đa hình. Các mẫu Đàn hương trắng thuộc 8 xuất xứ có mức độ đa dạng di truyền ở mức thấp với các giá trị trung bình lần lượt là Na = 1,417; Ne = 1,225; I = 0,223; h = 0,149 và P = 41,73%. Phân tích AMOVA về mức độ sai khác di truyền tối đa giữa các xuất xứ ở mức độ tương đối cao đạt 49% và mức độ sai khác di truyền giữa các mẫu trong cùng xuất xứ đạt 51% (PhiPT = 0,509). Kết hợp cây quan hệ di truyền với cấu trúc quần thể STRUCTURE đã phân chia các xuất xứ thành 3 nhóm, với nhóm I gồm 4 nguồn giống có nguồn gốc Ấn Độ (AnDo1, AnDo2, AnDo3 và VNam1), nhóm II gồm 3 xuất xứ có nguồn gốc từ Indonesia và nhóm III gồm 2 nguồn giống có xuất xứ từ Ấn Độ là xuất xứ đã được công nhận tại Việt Nam (VNam2 và AnDo4). Kết quả này cung cấp cơ sở di truyền trong xác định nguồn gen tiềm năng, phục vụ công tác lưu giữ và khai thác các mẫu Đàn hương trắng nhập nội ở Việt Nam.
Tài liệu tham khảo
Doyle J.J., Dickson E.E., 1987. Preservation of Plant Samples for DNA Restriction Endonuclease Analysis. Taxon. 36(4): 715-22.
Earl D.A., Vonholdt B.M, 2012. Structure Harvester: A Website and Program for Visualizing Structure Output and Implementing the Evanno Method. Conserv. Genet. Resour. 4:359–361.
Fatima T,, Srivastava A., Hanur V.S., Srinivasa Rao M., 2021. Assessment of Genetic Diversity and Population Genetic Structure of Santalum album L. in India by Genic and Genomic SSR markers, bioRxiv.
Isshiki S., Iwata N., Khan M.M.R., 2008. ISSR variations in eggplant (Solanum melongena L.) and related Solanum species. Scientia Horticulture.117: 186–190.
Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K., 2018. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across Computing Platforms, Mol Biol Evol. 35(6):1547-1549.
Nurochman D., Matangaran J.R., Santosa G., Suharjito D., Sari R. K., 2019. Evaluation of genetic diversity of sandalwood (Santalum album L.) in aceh, Indonesia and it's essential oil characteristics: Evaluasi keragaman genetik cendana di Aceh, Indonesia dan karakteristik minyaknya. Malaysian Journal of Science. 38(2): 31-46.
Peakall R., DNA P.E., Smouse, 2006. Genalex 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching DNA research. Molecular Ecology Notes. 6(1): 288-295.
Pritchard J.K., Stephens M.J., Donnelly P.J., 2020. Inference of Population Structure Using Multilocus Genotype Data. Genetics.155:945–959.
Sandeep C., Kumar A., Rodrigues V., Viswanath S., Shukla A.K., Sundaresan V., 2020, Morpho-genetic divergence and population structure in Indian Santalum album L. Trees. 34: 1113-1129.
Suma T.B., Balasundaran M., 2003. Isozyme variation in five provenances of Santalum album in India. Australian Journal of Botany. 51(3): 243-249.
The Plant List, 2010. Santalum album L. 356-371.
Vũ Văn Thoại, 2020. Nghiên cứu chọn giống, trồng và chế biến sản phẩm trà từ lá Đàn hương trắng (Santalum album L.) ở một số vùng sinh thái (Tây Bắc, Nam Trung Bộ và Tây Nguyên).
Yeh F.C., Yang R.C., Boyle T., Ye Z.H., Mao J. X., 1999. POPGENE, version 1,32: the user friendly software for population genetic analysis. Molecular biology and biotechnology centre, University of Alberta, Edmonton, AB, Canada.
Đã Xuất bản
Cách trích dẫn
Số
Chuyên mục
