Genetic diversity assessment and genetic resources indentification of (Scaphium macropodum (Miq) using moleculer markers

Authors

  • Tran Thi Thu Ha Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Ha Thi Huyen Ngoc Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Nguyen Thi Huyen Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Le Thi Thuy Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Nguyen Thi Viet Ha Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Mai Thi Phuong Thuy Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Le Son Viện Nghiên cứu Giống và Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Pham Dinh Sam Viện Nghiên cứu Lâm sinh - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Nguyen Huu Thinh Viện Nghiên cứu Lâm sinh - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Hoang Thi Nhung Viện Nghiên cứu Lâm sinh - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam
  • Ho Trung Luong Viện Nghiên cứu Lâm sinh - Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam

Keywords:

Genetic diversity,, gene resources, ITS (Internal Transcribed Spacer) marker, Scaphium macropodum

Abstract

Scaphium macropodum is a multi-purpose species that grows fast and is
very valuable in Vietnam. However, the exploitation of this species by
cutting branches is popular at present, triggering this species for being in
danger of being threatened. Therefore, in this study, we have used the ITS
marker to sequencing and have identified 25 sequence segments of 25 leaf
samples of S. macropodum collected from Quang Nam, Quang Ngai and
Thua Thien Hue provinces that have similarities in the range from 94.01%
to 94.46% with reference sample AY083663.1 Scaphium lychnophorum. At
the same time, research results have also determined that the genetic
similarity of the nucleotide sequence of the samples is very high (ranging
from 97.96 - 99.85%). Based on the phylogenetic tree, 25 S. macropodum
samples in the study and the reference sample were divided into two main
groups. The results of this study are very important for the proper
exploitation and the conservation of the genetic resources of this important
indigenous plant species as well

References

1. Nguyễn Tiến Bân, 2003. Sterculiaceae Barth. 1830 - Họ Trôm. Danh lục các loài thực vật Việt Nam, tập II. Trang 548. NXB Nông nghiệp, Hà Nội.

2. Võ Văn Chi, 1999. Từ điển cây thuốc Việt Nam. Trang 685 - 686. NXB Y học, Hà Nội.

3. Hồ Hỷ, 2005. Ươi bay, một tiềm năng lớn chưa được phát triển ở Thừa Thiên Huế. Bản tin LSNG. Mạng lưới lâm sản ngoài gỗ Việt Nam. 2 (3): 22 - 25.

4. Bellarosa R., Simeone M. C., Papini A. and Schirone., 2005. Utility of ITS sequence data for phylogenetic reconstruction of Italian Quescus spp.. Plant Phyl. Evol. 34: 355 - 370.

5. Van B.C., Higgins W. E., Dressler R. L., Whitten W. M., Soto Arenas M. A., CulhamA., Chase M. W., 2000. A phylogenetic analysis of Laeliinae (Orchidaceae) based on sequence data from nuclear internal transcribed spacers (ITS) of ribosomal DNA. Lindleyana 15 (2): 96 - 114.

Published

04-04-2024

How to Cite

[1]
Ha, T.T.T. et al. 2024. Genetic diversity assessment and genetic resources indentification of (Scaphium macropodum (Miq) using moleculer markers. VIETNAM JOURNAL OF FOREST SCIENCE. 3 (Apr. 2024).

Issue

Section

Articles

Most read articles by the same author(s)

1 2 3 4 5 > >> 

Similar Articles

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 > >> 

You may also start an advanced similarity search for this article.