ĐA DẠNG DI TRUYỀN VÀ CẤU TRÚC QUẦN THỂ NGUỒN GEN CHÒ NƯỚC (Platanus kerrii Gagnep) TẠI MỘT SỐ TỈNH PHÍA BẮC BẰNG CHỈ THỊ ISSR
DOI:
https://doi.org/10.70169/VJFS.1177Từ khóa:
Cấu trúc quần thể, đa dạng di truyền, đặc hữu, ISSR, Platanus kerrii GagnepTóm tắt
Chò nước (Platanus kerrii Gagnep) là loài cây đặc hữu của Việt Nam có giá trị khoa học, giá trị bảo tồn, giá trị dược liệu và có tiềm năng lớn về kinh tế. Hiện nay, các nghiên cứu về Chò nước mới chỉ tập trung về phân bố, đặc điểm lâm học, kỹ thuật trồng nên việc đánh giá đa dạng di truyền nguồn gen hiện có là cần thiết để định hướng cho công tác bảo tồn và phát triển nguồn gen loài cây này trong thời gian tới. Nghiên cứu này phân tích 30 mẫu Chò nước thuộc 3 xuất xứ Hòa Bình, Thái Nguyên và Bắc Kạn bằng 10 chỉ thị ISSR nhằm đánh giá mức độ đa dạng di truyền và cấu trúc quần thể nguồn gen hiện có. Kết quả thu được cho thấy, mức độ đa dạng di truyền của loài ở mức trung bình cho đến cao (h = 0,273) với sự khác biệt di truyền giữa các xuất xứ tương đối lớn (GST= 0,2232) và tần số trao đổi gen giữa các xuất xứ là tương đối thấp (Nm = 1,7400). Phân tích cấu trúc quần thể chỉ ra sự khác biệt về mặt di truyền của 3 xuất xứ Chò nước và được chia thành ba nhóm rõ rệt với tỷ lệ các mẫu tập trung mỗi nhóm cao. Kết quả nghiên cứu này góp phần cho công tác bảo tồn và phát triển nguồn gen loài cây này trong thời gian tới.
Tài liệu tham khảo
1. Allendorf, E.F., Funk, C. W, Aitken, S. N., Byrne, M., Luikart, G., 2022. Conservation and the Genomics of Populations. Oxford University Press, London, UK.
2. Bộ Khoa học Công nghệ, 2007. Sách Đỏ Việt Nam, phần Thực vật. NXB Khoa học tự nhiên và Kỹ thuật, Hà Nội, 302-303.
3. Earl, D.A., Vonholdt, B.M., 2012. Structure Harvester: A Website and Program for Visualizing Structure Output and Implementing the Evanno Method. Conserv. Genet. Resour. 4:359 - 361
4. Ellstrand, N.C., 1992. Gene flow among seed plant populations. New Forest 6, 241–256.
5. Galván-Hernández, D. M., Lozada-García, J. A., Flores-Estévez, N., Galindo-González, J., & Vázquez-Torres, S. M., 2015. Variation and genetic structure in Platanus mexicana (Platanaceae) along riparian altitudinal gradient. International Journal of Molecular Sciences, 16(1), 2066-2077. DOI: 10.3390/ijms16012066
6. Huang, W. J., Ning, G. G., Liu, G. F., & Bao, M. Z., 2009. Determination of genetic stability of long-term micropropagated plantlets of Platanus acerifolia using ISSR markers. Biologia Plantarum, 53, 159 - 163.
7. Jordano, P., 2010. Pollen, seeds and genes: The movement ecology of plants. Heredity, 105, 329 - 330
8. Kumar, S., Stecher, G., Li, M., Knyaz, C., & Tamura, K., 2018. MEGA X: molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Molecular biology and evolution, 35(6), 1547 - 1549. DOI:10.1093/molbev/msy096
9. Lee, J. Y., Han, M. S., & Shin, C. S., 2012. Variant identification in Platanus occidentalis L. using SNP and ISSR markers. Korean Journal of Plant Resources, 25(3), 308-316.
10. Muhammad, I. and Muhammad, I., 2014. Molecular markers in plants for analysis of genetic diversity: A review. European Academic Research, 2(1), 1513–1540.
11. Peakall, R. O. D., & Smouse, P. E., 2006. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular ecology notes, 6(1), 288 - 295. DOI: 10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x
12. White, T. L., 2007. Forest Genetics. CAB International.
13. Yeh, F. C., Yang, R. C., Boyle, T. B. J., Ye, Z. H., & Mao, J. X., 1997. POPGENE, the user-friendly shareware for population genetic analysis, version 1.31. Molecular Biology and Biotechnology Centre, University of Alberta, Alberta.
