Study genetic diversity of Aleurites moluccana (L.) Willd’s provenances by RAPD markers
Keywords:
Aleurites moluccana, genetic diversity, RAPDAbstract
Genetic diversity of 31 Aleurites moluccana trees from five provenances (Bac Kan, Lang Son, Thanh Hoa, Nghe An and Gia Lai) were evaluated by seven polymorphic RADP markers (OPN16, OPH08, OPR08, OPAL8, OPAK14, OPA4, OPAB5). Seven RAPD markers amplified 31 individual trees and produced 960 bands with size ranges from 100 bp to 950 bp. The polymorphic level ranged from 54.34% to 64.83%. Dendrogram obtained from 31 trees with UPGMA method showed 2 main clusters with similarity coefficient of 0.8. Cluster I comprised 16 individuals from Thanh Hoa, Nghe An and Gia Lai and having similarity coefficient from 0.84 to 1.00 and divided into three sub - clusters. Cluster II comprised 15 trees from Bac
Kan and Lang Son provinces and contained 2 sub - clusters with similarity coefficient from 0.915 - 0.985.
References
1. Basha, S. D. and Sujatha, M., 2009. Genetic analysis of Jatropha species and interspecific hybrids of Jatropha curcas using nuclear and organelle specific markers. Euphytica 168, 197 - 214.
2. Gawel, N. J. and Jarret, R. L., 1991. A modified CTAB DNA extraction procedure for Musa and Ipomoea. Plant Molecular Biology Reporter 9, 262 - 266.
3. Lương Văn Tiến, Vũ Hoàng Phương và Hoàng Văn Thắng, 2012. Kết quả nghiên cứu bước đầu về thành phần hóa học của dầu hạt Lai (Aleurites molucana). Tạp chí Khoa học Lâm nghiệp 2, 2273 - 2279.
4. Nguyễn Hoàng Nghĩa, Nguyễn Đức Thành, Trần Thùy Linh, 2007. Kết quả phân tích đa dạng di truyền loài Gõ đỏ (Afzelia xylocarpa (Kurz) Craib.) bằng chỉ thị phân tử RAPD Tạp chí Nông nghiệp và Phát triển nông thôn 14, 44 - 48.
5. Nguyễn Hoàng Nghĩa, Trần Thanh Trang, Đỗ Tiến Phát, Nguyễn Văn Phượng, Lê Văn Sơn và Chu Hoàng Hà, 2009. Phân tích đa dạng di truyền hệ gen nhân của loài Mỡ Hải Nam bằng chỉ thị RAPD và cpSSR. Tạp chí
Khoa học Lâm nghiệp 2, 918 - 925.
6. Nguyễn Quang Khải và Khuất Hữu Trung, 2007. Nghiên cứu đa dạng di truyền một số giống Sở (Camellia sp.) của Việt Nam bằng kỹ thuật RAPD. Tạp chí Khoa học Lâm nghiệp 4, 452 - 459.
7. Phí Hồng Hải và Nguyễn Hoàng Nghĩa, 2013. Báo cáo kết quả công tác bảo tồn và phát triển nguồn gen cây lâm nghiệp tại Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam giai đoạn 2011 - 2013 và định hướng công tác đến năm 2020. Tuyển tập báo cáo Hội nghị đánh giá kết quả hoạt động khoa học công nghệ về quỹ gen (giai đoạn 2011 -2013). Nhà xuất bản Khoa học và Kỹ thuật Hà Nội - Việt Nam, 130 - 148.
8. Rohlf, F. J., 2008. NTSYSpc: Numerical Taxonomy System, ver. 2.20. Exeter Publishing, Ltd.: Setauket, NY.
9. Williams, J. G. K., Kubelik, A. R., Livak, K. J., Rafalski, J. A. and Tingey, S. V., 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Research 18, 6531 - 6535.
