PHÂN TÍCH ĐA DẠNG DI TRUYỀN QUẦN THỂ LAN LƯỠI NGỰA LÁ THUÔN [Rhomboda lanceolata (Lindl.) Ormd] Ở LÂM ĐỒNG BẰNG CHỈ THỊ PHÂN TỬ RAPD
Từ khóa:
Lan lưỡi ngựa lá thuôn, Đa dạng di truyền quần thể, RAPD.Tóm tắt
Ba nhóm tuổi của quần thể Lan lưỡi ngựa lá thuôn được thu thập ở vùng núi Lang
Bian, Lâm Đồng, Việt Nam để phân tích đa dạng di truyền. Trong nghiên cứu này, chỉ thị
RAPD được sử dụng để khảo sát biến động di truyền ở 30 cá thể từ quần thể đó. Có 28 band
được ghi nhận từ 11 mồi nhận diện đặc trưng. Tỷ lệ đa hình ở mức độ loài là thấp (Pt =
76,92%); tỷ lệ đa hình giữa các nhóm trong quần thể cũng được ghi nhận là thấp, dao động từ
59,23% đến 64,61%, trong đó nhóm tuổi 1 có tỷ lệ đa hình là cao nhất. Tính dị hợp tử ở mức độ
loài là thấp (HEt = 0,269), tuy nhiên ở mức độ quần thể có sự khác nhau giữa các nhóm tuổi, trong
đó nhóm 1 là cao nhất (HE1 = 0,296 đối với nhóm tuổi 1; HE2 = 0,190 đối với nhóm tuổi 2; HE3 =
0,1893 đối với nhóm tuổi 3). ức độ iệt hóa gene giữa c c quần thể là thấp (GST = 0,2125).
Khoảng cách di truyền giữa nhóm tuổi 1 và nhóm tuổi 2 là: D12 = 0,49; giữa quần thể 1 và
quần thể 3 là: D13 = 0,51 và giữa quần thể 2 và nhóm tuổi 3 là: D23 = 0,48. Kết quả về phân
tích lập nhóm theo phương ph p UPG A hình thành 4 nhóm tuổi khác nhau (gồm nhóm 1, 2,
3 và kết hợp giữa các nhóm tuổi khác nhau).
Tài liệu tham khảo
Anatonovis J., 1984. Genetic variation within population. In Dirzor R., Sarukan J. (eds)
perspectives on plant population biology. Sinauer, Sunderland, 229-241.
Ang L., Luo Y. B., Xiong Z. T. and Song G. E., 2002. A Preliminary study on conservation
genetics of three endangered Orchid species. Acta Botanica Sinica, 44(2): 250-252.
Averyanov L. V. & Averyanova A. L., 2003. Updated checklist of the orchids of Vietnam.
Vietnam National University Publishing House, Hanoi, Vietnam.
Beardmore J.A., 1983. Extinction, survival and genetic variation. In: Schoenwald-Cox C.M.,
Chamber S.M., Macbryde B., Thomas L. (eds). Genetics and Conservation. BenjaminCummings, Menlo Park, 125-151.
Carmen M., Teresa P., Margarita C. M. and Esteban H. B., 2008. Genetic Diversity and
Structure of the Endangered Betula pendula subsp. fontqueri Populations in the South
of Spain. Silva Fennica 42(4): 487–498.
Ceska J. P., Afollter J. M. and Hamrich J. C., 1997. Developing a sampling strategy for
Raptisia arachiifera based on allozyme diversity. Conservation Biology, 11: 1133-
Dharmar K. and John A. D. B., 2011. RAPD analysis of genetic variability in wild
populations of Withania somnifera (L.) Dunal. International Journal of Biological
Technology, 21-25.
Hogbin P. M. and Peakall R., 1999. Evalution of the contribution of the genetic research to
the management of the endangered plant Zieria prostrate. Conservation Biology, 13:
-522.
Jennifer M. C. and Hamrick J. L., 2004. Genetic Diversity in Harverted and Protected
Populations of Wild American Ginseng, Panax Quinquefolius L. (ARALIACEAE).
American Journal of Botany, 91(4): 540–548. 2004.
IPGRI and Cornell University, 2003. Measures of genetic diversity.
Kurt W., Hilde N., Kirsten W. and Kahl G., 2005. DNA Fingerprinting in plants principles,
methods, and applications (second Edition). Cpc press Taylor & Fancies group.
Lynch M. and Milligan B. G., 1994. Analysis of population genetic structure with RAPD
markers. Molecular Ecology, 3 (2): 91–99.
Milligan B. G., Leebens-M. J. and Strand A. E., 1994. Conservation genetics: Beyond the
maintenance of marker diversity. Molecular Ecology, 12: 844–855.
Nei. M., 1972. Genetic distance between populations. American Naturalist 106: 283-292.
Nei M., 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number
individual. Genetics 9: 583-590.
Nei M., and Tajima F., 1981. DNA polymorphism detectable by restriction endonucleases.
Genetics 97: 145-163.
Nei M., and Tajima F., 1983. Maximum likelihood estimation of the number of
nucleotide substitutions for restriction sites data. Genetics 105: 207-216.
Nei M. and Jin L., 1989. Variances of the average numbers of nucleotide substitutions
within and between populations. Molecular Biology Evolution 6: 240-300.
Nei M. and Miller J. C., 1990. A Simple Method for Estimating Average Number of
Nucleotide Substitutions Within and Between Populations From Restriction Data.
Genetics Society of America. 125: 873-879.
Pvingila D., Verbylaitë R., Baliuckas V., Pliûra A. and Kuusienë S., 2005. Genetic diversity
(RAPD) in natural Lithuanian populations of common ash (Fraxinus excelsior L.).
Biologija, 3: 46–53.
Sergei V. Bahtiyour Y., Irina S., David W. Varda Z. and Samuel M.et al., 2001. Tests for
adaptive RAPD variation in population genetic structure of wild barley, Hordeum
spontaneum Koch. Biological Journal of the Linnean Society, 74: 289–303.
Steele P. R. and Pires J. C., 2011. Biodiversity assessment: State of the art techniques in
phylogenomics and species indentification. American Journal of Botany, 98:415-415.
Robichaux R. H., Friar E. A., Mount D. W. 1997. Molecular genetics consequences of a
population bottleneck associated with reintroduction of the Mauna Kea Silverwoold
(Argyroxiphium sanwicense spp. sanwicense L. [Asteraceae]. Conservation Biology,
: 1140-1146.
William J. G. K., Kubelik A. R., Livak K. J., Rafalski J. A. and Tingey S. V., 1990. DNA
polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic
Acids Reseach, 6531 - 6535.
Woff P. G. & Sinclair R. B., 1997. Highly differentiated populations of the narrow endemic
plant Maquire Primrose (Primula maguirei). Conservation Biology, 11: 375-391.
